WAGENINGEN - Wageningen UR en KeyGene hebben samen met hun partners in het Tomato Genome Consortium (TGC) het genoom ontrafeld van de tomaat en van zijn wilde voorouder Solanum pimpinellifolium.
Deze doorbraak zal er toe leiden dat wereldwijd de veredeling van tomaten sneller en goedkoper kan worden uitgevoerd en waardoor nieuwe variëteiten, die bijvoorbeeld minder gevoelig zijn voor ziektes of droogte, kunnen worden ontwikkeld, aldus Wageningen UR.
Ook de veredeling van andere gewassen zal naar verwachting profiteren van dit resultaat. De DNA-volgordes van de tomaat en zijn voorouder zijn deze week gepubliceerd in het wetenschappelijke tijdschrift Nature.
- De publicatie van de DNA-volgorde plus analyse van deze volgorde, geeft de meest nauwkeurige beschrijving van alle onderdelen van het tomatengenoom tot nu toe, waarbij de positie, de volgorde en de functie van meer dan 35.000 genen in kaart zijn gebracht. Deze informatie zal voor onderzoekers van groot belang zijn om de relatie tussen de genen en de eigenschappen van tomaat beter te begrijpen.Daarmee zullen ze meer inzicht krijgen in hoe milieufactoren samen met genetische eigenschappen samen zorgdragen voor een gezonde en optimale oogst.
Nachtschaden
Tomaat behoort tot de plantenfamilie van de Nachtschaden en het is te verwachten dat met de DNA-volgorde van tomaat ook nuttige genen in andere leden van de nachtschadenfamilie kunnen worden opgespoord. Deze familie, waartoe onder andere aardappel, paprika, Spaanse peper en aubergine behoren, vormt wereldwijd de grootste groentefamilie zowel in economisch opzicht als in totale voedselproductie. Tot de nachtschadenfamilie horen ook soorten die worden gebruikt als specerij, voor medicinale toepassingen of als sierplanten.
De gepubliceerde analyse van de twee DNA-volgordes laat ook zien hoe tomaat vanuit verre voorouders geëvolueerd is en hoe de soort zich in de loop der tijd heeft aangepast aan steeds weer wisselende omstandigheden. Zo is ontdekt dat 60 miljoen jaar geleden, ongeveer gelijktijdig met het massaal uitsterven van de dinosaurus, het genoom van de tomaat plotsklaps sterk in grootte is toegenomen. Het meeste van dit extra DNA is inmiddels al weer verdwenen maar een aantal van de extra genen die toen ontstaan zijn, zijn nog steeds terug te vinden in de hedendaagse tomaat waar ze verantwoordelijk zijn voor een aantal van de meest belangrijke eigenschappen die tomaat zo smakelijk en gezond maken.
Consortium
Het TGC, een samenwerkingsverband tussen meer dan 300 onderzoekers uit 14 verschillende landen, is opgericht tijdens een wetenschappelijke bijeenkomst in 2003 in Washington DC. Het consortium bestaat uit verschillende onderzoeksgroepen afkomstig uit Argentinië, België, China, Engeland, Frankrijk, Duitsland, India, Israel, Italië, Japan, Nederland, Spanje, de Verenigde Staten en Zuid-Korea.
Alle informatie over het tomatengenoom kan worden gedownload van de Solgenomics website.
Lees ook:
- Tomaat met biolabel smaakt beter (3 april 2012)
- Nederland steunt genenbank gewassen (5 augustus 2011)
- Genoom aardappel ontrafeld (11 juli 2011)